Miejskie Przedsiębiorstwo Energetyki Cieplnej w Krakowie jest Spółką Akcyjną, której sposób organizacji, zarządzania oraz działania regulują odpowiednie przepisy Kodeksu Handlowego.

Właścicielem 100% akcji Przedsiębiorstwa jest Gmina Miasta Krakowa, której majątkiem dysponuje Prezydent Miasta Krakowa. Posiadane przez Gminę akcje: MPEC S.A, MPK S.A oraz MPWiK S.A zostały wniesione w 1999 r do nowopowstałej Spółki - Krakowski Holding Komunalny.

Podstawowym aktem regulującym działalność Spółki jest Statut Miejskiego Przedsiębiorstwa Energetyki Cieplnej S.A, który określa nazwę Spółki, jej siedzibę, przedmiot działalności, wysokość kapitału oraz władze Spółki.

W skład władz MPEC S.A wchodzi:

Walne Zgromadzenie

Funkcję Walnego Zgromadzenia pełni Prezydent Miasta Krakowa

Rada Nadzorcza

Zarząd MPEC S. A.